يحتوي مختبر الكيمياء العضوية على العديد من المرافق الحديثة لتحضير واستخلاص وتنقية وتركيز العديد من المركبات العضوية: (إجمالي الهيدروكربونات البترولية TPH)، والهيدروكربونات العطرية متعددة الحلقات (PAHs)، وثنائي الفينول متعدد الكلور (PCBs)، والعديد من الزيوت والشحوم في العديد من المصفوفات (الماء والرواسب والتربة والأنسجة النباتية والحيوانية وغيرها).
المختبر مجهز بأحدث الأدوات التحليلية (GC-MSD, GC-FID, GC-ECD)، وجهاز استخلاص المذيبات المتسارع، بالإضافة إلى أجهزة تحليل TOC/TN التي توفر للباحثين البيانات التحليلية الدقيقة. حصل مختبر الكيمياء العضوية على الاعتماد الدولي (ISO/IEC 17025) من الجمعية الأمريكية لاعتماد المختبرات (A2LA).