تشتمل أنشطة المراقبة الصحية التي تُجرى داخل مركز أبحاث حيوانات المختبر على ثلاثة جوانب:
الفحص السريري اليومي:
يتولى طبيب بيطري أو فني الحيوانات بالمركز فحص القوارض، وذلك للبحث عن علامات تدل على مرض أو إصابة أو سلوك غير طبيعي في الحيوانات.
برنامج المراقبة الصحية (الحارس):
تُستخدم القوارض الحارسة لمراقبة الحالة الصحية للفئران ومستعمرات الفئران، وذلك وفقًا لتوصيات "اتحاد الرابطات الأوروبية لعلوم الحيوانات المختبرية".
برنامج المراقبة البيئية:
تُجرى العديد من الفحوصات المخبرية، وذلك للتأكد من جودة عمليات التنظيف والتعقيم داخل المركز.